В 1995 году УлГТУ занимался гуманитаризацией инженерного образования. Приветствовались идеи об открытии междисциплинарных специальностей. Примером такой специальности стала Прикладная информатика в экономике, т.к. выпускники получали двойную специальность: инженер-экономист.
С идеей об открытии такой специальности выступили декан ФИСТ Никищенков Игорь Александрович и доцент кафедры «Вычислительная техника» Ярушкина Надежда Глебовна. Для этого на кафедре «Вычислительная техника» был создан цикл «Информационные системы в экономике». Заведовать циклом стала доцент Ярушкина Н.Г. В 1995 году был сделан первый набор студентов на цикл.
По мере развития цикла стало очевидно необходимость создания самостоятельной кафедры, которая была создана по приказу ректора 30 сентября 1997г.